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O transplante de microbiota fecal (TMF) constitui uma opção terapêutica eficaz na infeção a Clostridium difficile (ICD) recorrente, que é atualmente a única indicação aprovada. Contudo, foram já apontadas áreas de potencial interesse para aplicação como a erradicação de microrganismos multirresistentes. A colonização intestinal por Klebsiella pneumoniae produtora de carbapenemases (KPC) tem sido cada vez mais relatada e estima-se que 10% dos doentes desenvolverão infeção. As infeções por KPC estão frequentemente associadas à falência do tratamento sendo a taxa de mortalidade ≥50%. A descolonização intestinal do KPC pode prevenir a transmissão e infeção por este agente.