A infeção retal por Chlamydia trachomatis é comum em homens que têm sexo com homens (10%) e é frequentemente assintomática (>70%). Quando a infeção é sintomática, manifesta-se com sintomas ligeiros como prurido e mucorreia/rectorragias. Raramente, pode mimetizar outras patologias como Doença de Crohn ou neoplasias colorrectais